In de beginjaren 2000 gaan veel leden van de Evangelische Gemeente Nehemia over naar de Baptistengemeente in Notter. De terugloop in leden heeft tot gevolg dat de gemeente zich in 2011 opheft.
Evangelische Gemeente Nehemia
Afscheiding uit de Volle Evangelie Gemeente
In 1994 komt uit Canada de Toronto Blessing in Nederland. De Blessing is een vorm van aanbidding door handoplegging de Heilige Geest te ontvangen. De uitwerking van deze aanbidding verscheurt de Evangelische wereld. Ook in Rijssen komt het tot een scheuring in de Volle Evangelie Gemeente Rijssen. Een groep principiële tegenstanders van deze zegen stap uit de VEG Rijssen en stichten de een nieuwe Evangelische Gemeente Nehemia. Ze houden hun samenkomsten in het clubgebouw van muziekvereniging Wilhelmina aan de Morsweg.